近年来，公共卫生事业飞速发展。同时，公共卫生安全形势随着外部环境的改变而不断变化，影响公共卫生安全的因素也相应增多。<br>
　　一、自然环境因素。人类生存环境的自然变化和自然灾害频繁发生，引发一系列公共卫生安全问题，这种危害随着人口聚集度的增加日益严重。人类过度利用自然资源，导致自然环境遭到人为破坏，使可利用淡水资源缺乏，土地荒漠化，空气污染、水污染、海洋污染等，这一切变化都会时公共卫生安全造成严重影响。严寒、高温、洪水、暴风雨等气候异常事件，直接影响人类的健康和生命：生态环境改变造成人与动物疾病、细菌病毒变异和数量的改变，使新发和古老疾病流行。<br>
　　二、社会、经济因素。工业化和现代化的进程加快，大城市的过度扩张，加大了城市空气、水源、噪声、化学性等环境污染，也带来了生态效应和城市热岛等问题。这些对城市居民甚至城市周边人群的健康都形成了新的威胁。如城市化加快，导致了城市人口激增，使住房和交通拥挤，生活空间缩小；就业竞争激烈、工作压力加剧、贫富差距拉大，这些社会问题不仅会引发犯罪率升高，还会引起自杀、精神疾患等公共卫生问题的增力口。<br>
　　三、重大传染病疫情。一是现有传染病时有爆发和流行。在一些不发达地区，传染病、地方病和寄生虫病仍是当前面临的主要卫生问题。二是新发传染病不断出现和爆发流行。如艾滋病、肠出血性大肠杆菌O157：H7、莱姆病、军团菌病的发生与流行。三是人畜共患病。许多传染病具有动物来源，这是传染病无法消除的重要原因。如禽流感，不仅能导致大批禽类动物死亡，造成巨大经济损失，而且一旦传入人群，会给人类带来巨大灾难。四是不明原因疾病爆发流行。如果缺乏有效的诊疗和控制手段，极易在人群中爆发流行，引起社会恐慌。<br>
　　四、食品卫生安全。一是食源性疾病与中毒。食源性疾病是严重影响人类健康的世界性公共卫生问题，发生率均居高不下。二是职业卫生安全。我国是一个发展中国家，工业化进程带来的空气、水源、噪声、化学性污染日趋严重。而不少企业劳动条件差，职业危害还比较严重，形势不容乐观。<br>
　　五、环境污染事故。一是核辐射污染。核电虽是清洁、安全的能源，但不能完全排除发生严重事故的可能。目前，我国已有多个核电机组在运行，周边国家和地区也分布着大量的核电站及其他核设施。这些核设施如发生核事故或遭受恐怖袭击，所产生的放射性污染也势必影响我国的公共卫生安全。二是饮用水污染。我国城乡居民生活饮用水质量成为公共卫生的薄弱环节，农村饮用水问题表现更为突出。饮水中微生物指标严重超标，存在肠道传染病爆发流行的危险。贫困地区饮水中氟、砷浓度严重超标，经常引发氟、砷中毒事件。<br>
　　六、重大工程的卫生安全。一些重大工程建设在获得巨大经济效益的同时，给生态环境带来的影响往往难以预测，给人民健康和生命安全带来了严重影响。<br>
　　七、生物恐怖主义。尽管国际间已经缔结了各种各样的禁止生物武器公约，但世界上一些国家，仍然在大量储存并继续发展生物武器，以高科技为基础的生物战剂不断出现，这些生物战剂不但杀伤力巨大，而且更难防范。恐怖主义的出现，对生物安全构成了新的威胁。生物恐怖主义超出了一切生物战的常规，使用随处可得的杀伤性微生物，使用各种非常规的攻击手段，甚至不惜采用自杀式攻击，这样的袭击常能造成极大破坏作用，而且极难防范。当今，便于施放、隐蔽性强、杀伤力大、具有心理威慑力的生物、化学战剂已成为了恐怖主义袭击的一种新工具。